元亀4年(1573) 三河からの帰路で武田晴信 (信玄)は病死する。家督を継いだ勝頼は家康・信長に対抗したものの、天正3年(1575) 長篠の戦いで大敗し、天正10年(1582) までに武田氏は滅びた。武田氏滅亡後、本能寺の変とその後の混乱を経て伊那谷は徳川家康の支配下となり、天正18年(1590) 豊臣政権下で家康が関東に転封されると毛利秀頼の支配となった。このとき検地が行われ、天正19年(1591) の検地帳に根羽村 (近世 根羽・月瀬 2村) は「信州伊奈郡」の「下条領」に含まれ、信濃国して把握された。
詳細は『22. 根羽村』を参照。

なお根羽村にはやっぱり『ネバーランド』がある (レストランなどの複合施設)。